因為世界政府要處決白鬍子海賊團第二隊隊長波特卡斯·D·艾斯，世界政府對“王下七武海”下發強制召集的命令 ，但漢庫克出場後表明自己不想去，又不想放棄“王下七武海”的地位，於是將海軍軍艦上的所有士兵（鼯鼠中將利用小刀刺傷自己的手以集中注意力因而避免中招）石化外，還掠奪了軍艦上的貨物。
當她回到九蛇宮殿的時候，見到艾妮西塔將孩童們特地依照她的形象、所塑造的人形雕偶帶進宮殿，立刻動手將雕像摧毀，並且在古羅莉歐薩勸諫她參與海軍徵招令時，以“即使造成國家滅亡，也會得到大家的原諒，因為妾身美若天仙”為由，將後者直接拋出窗外。
波雅·漢庫克準備洗澡後，侍衛們擺下護陣，但被女兒島衛兵追趕的蒙奇·D·路飛卻不小心落入了漢庫克的澡池，並且看到漢庫克後背上的圖案，因此漢庫克非常生氣，使用“甜甜甘風”，但由於路飛是橡皮人和完全沒用色心的緣故而無效，她非常驚訝為何路飛沒有石化、為何路飛沒有對她赤裸的身體沒有動心。路飛尋找出口逃出去，但很快被護衛捉住。
憂鬱的女帝
波雅·漢庫克準備處決路飛，瑪格雷特、艾佛蘭德拉、斯多比為路飛求情被她石化。波雅·桑達索尼亞和波雅·瑪麗哥魯德準備在處刑場殺掉路飛，但桑達索尼亞準備摔碎瑪格雷特，路飛憤怒的使出了“霸王色霸氣”，其中漢庫克的妹妹波雅·桑達索尼亞落敗後懸掛在決鬥場邊緣，由於戰鬥中被小妹波雅·瑪麗哥魯德身上的火炎波及，使她衣服被燒毀之虞差點露出了印記，路飛卻在此刻攀爬到她背上，以身軀掩蓋印記，此舉讓漢庫克與九蛇島人民對路飛徹底改觀。問路飛選擇恢復瑪格雷特等人還是自己離開，路飛毫不猶豫的讓她們恢復，於是漢庫克打算告訴路飛她的過去。
波雅·漢庫克把路飛叫到她的住處，從古羅莉歐薩口中得知路飛毆打了天龍人的事情，於是漢庫克把自己的過去一切都告訴了路飛，並說她中意了路飛決定幫助路飛。後來得知路飛準備去推進城救出艾斯的時候，原本不願參加頂上戰爭，但為了幫路飛營救艾斯，於是接受了世界政府的“強制召集”。
頂上戰爭波雅·漢庫克隨後將蒙奇·D·路飛藏在自己的衣服內助其成功潛入推進城。因為要進去檢查，於是只能送路飛到這裡，路飛臨走前感謝她卻被漢庫克誤以為求婚而差點暈倒。後來漢庫克叫麥哲倫署長帶自己去探望艾斯，在大監獄的第6層向被關押的艾斯傳達了路飛即將到來的訊息。
波雅·漢庫克之後搭乘軍艦前往海軍總部馬林梵多。在頂上決戰中雖然是與另四位七武海協同海軍一方與白鬍子海賊團開戰，但卻不分敵我的對戰場上的所有男人進行攻擊，還特地提到只有“那個人”除外。
在蒙奇·D·路飛遭到“白獵人”斯摩格攻擊時出手相救，並將艾斯的手銬鑰匙交予路飛，因而得到蒙奇·D·路飛感激的擁抱，此舉被女帝誤會為是傳聞中的“結婚”而開心得全身癱軟坐倒在地，這番情景又被周圍的海軍士兵誤以為被女帝被路飛以腰折（相撲招式）擊倒。之後，女帝繼續阻止斯摩格對路飛的追擊，讓路飛順利前往處刑台。
戰爭結束後，波雅·漢庫克藉助薩羅梅的追蹤能力，找到特拉法爾加·羅的船並把路飛帶回女兒島作進一步的治療，同時也是為了幫蒙奇·D·路飛躲避海軍的追蹤。迫於女兒島規矩的壓力，漢庫克不能與路飛見面，但得知路飛已經甦醒的時候，她再也抑制不住自己，馬上下令製作大量能補充體力的上好食物，並親自參與準備，作好後立刻為路飛送去。
