然而不到两个月，也就是1862年12月13日，李赢得了内战中南军最辉煌而北军最为凄惨的战役—菲特列堡战役（Fredericksburg），彻底地击败了刚刚上任的新任波特马克军团的司令安布罗斯-伯恩塞特（Ambrose Burnside）。李巧妙把北军引入了自己火炮的交叉射击区域，正面依托坚强的工事抵挡北军的正面攻势，两侧则用将近300门火炮进行不停歇地猛烈射击。北军在此遭受了巨大打击，而当力不能战撤退的时候，他们又不得不涉渡菲特列堡以西的大河，一时间秩序大乱再加上南军的炮火和追击，那里简直就成了北军的地狱。之后，北方三易其帅由胡克（Joseph Hooker）接手了伯恩塞特的位置，不过他的命运并不见得比他的前任好，在随后1863年5月中李又在查尔斯韦拉战役（Chancellorsville）中，依托李的坚强防守吸引住了北军主力，“石墙”杰克森则率大部从北军侧翼猛击。导致了北军波特马克军团的大举崩溃，伤亡惨重向北方迅速撤退。然而，李自己失去了他最为杰出的一名将军“石墙”杰克森，杰克森在一次意外中被南军自己误伤而死，这成为了对李而言的一个重大损失。
